二、使用 FAT32 檔案系統的 Windows 9x 作業系統升級到 Windows XP
如果是 Windows 9x 作業系統升級時出現此錯誤訊息時，很可能是您想要升級的磁碟原來是由不同容量的磁碟映像檔複製而來（例如原系統是由4GB 複製到 40GB 的硬碟），而且系統安裝的是 FAT32 的檔案系統，這個情形必須由 FAT32 BPB（BIOS Parameter Block）修正來解決此開機問題，詳細做法請參考微軟知識庫文件 KB314057。
三、您的電腦有兩個開機系統
Windows 作業系統允許您的電腦安裝為多重開機的系統，例如開機時可以選擇由 Windows 2000 或 Windows XP 開機，但是安裝的順序就很重要，順序不對就有可能造成開機 NTLDR missing 的錯誤訊息，詳細說明請參考微軟知識庫文件 KB322952與 KB315233。
五、NTLDR 毀損
關於 NTLDR 毀損可能是不正常系統重開機或硬體不良造成，要修復 NTLDR 可以透過將此一有問題的系統磁碟拆下，安裝到另一個可以正常起動的系統，再透過 Windows XP 光碟把完整的 NTLDR 檔案複製到有問題磁碟。如果沒有其他正常系統可用，這時候復原主控台（Recovery Console）大概是最佳的解決方案。
首先您必須有 Windows XP 安裝光碟，如果沒有合用的 Windows XP 安裝光碟，也可以製作 Windows XP 安裝程式開機片來使用復原主控台，請參考微軟知識庫文件 KB310994。
使用復原主控台修復 NTLDR 檔案步驟如下：
1. 放入 Windows XP 安裝光碟CD，1. 插入 Windows xp CD-ROM 並啟動 Windows xp 至修復主控台 (Recovery console)。
2. 輸入您所安裝的 Windows 作業系統，如您只有一個作業系統，請輸入 1 後按Enter 。
3. 輸入 Administrator 的密碼後按Enter 沒有設密碼者請直接按Enter。
輸入 map 然後按 Enter 。請記下您含有 Windows xp 安裝光碟的光碟機代號。
出現C:\WINDOWS>字串，請輸入 cd \跳到根目錄C:\
4. 輸入下列指令輸入每一列後按 Enter 。
而 <drive> 是您在步驟３所看到的光碟機代號。
copy <drive>:\i386\ntldr c:\ 輸入後 按 Enter
copy <drive>:\i386\ntdetect.com c:\ 輸入後 按 Enter
5. 如果系統提示您是否要覆蓋此檔案，輸入 Y 然後按 Enter 。
6. 接著鍵入「EXIT」，重新啟動系統測試是否正常。
如果想要進一步了解復原主控台操作，請參考微軟知識庫文件 KB314058。
因為人為因素造成「NTLDR is missing」錯誤訊息的情形很多，在嘗試解決此問題之前，最好先思考ㄧ下先前是否對電腦有作任何改變，如此才好對症下藥，加快問題的解決。