在木瓜皮、木瓜葉,以及木瓜莖中皆發現了抑制癌症的功效,美國國家癌症研究所(National Cancer Institute)已經證實木瓜的抗癌功效:一九九二至一九九五年間,美國國家癌症研究所的醫療化學及藥理處的科學家麥克林博士(Dr. Jarry L. McLaughlin)、張言博士(Dr. Yan Zhang,音譯)、葉青博士(Dr. Quing Ye,音譯)以及趙任賢(Geng-Xian Zhao,音譯)皆研究並支持木瓜的抗癌功效。經各方研究,科學家取得一致性的結論,也就是木瓜樹的所有部位都具有「抗癌」的功效,尤以葉子、莖和小分枝最為豐富。
澳洲政府甚至發表官方聲明,認為木瓜是能抗癌的醫藥植物。根據《木瓜:治癒疾病的奇蹟水果》(Papaya. Heilenmit der Wunderfrucht, 1998)一書作者芭芭拉.賽門森(Barbara Simonsohn)的說法,目前發現最早針對木瓜酵素運用的研究,是一九○六年六月十六日刊載於《英國醫療期刊》(The British Medical Journal)的一篇文章,作者布朗奇(W.J. Branch)於其中講述了其成功經驗:他藉由注射兩克的木瓜酵素成功地溶解了一顆腫瘤,「其中一顆腫瘤在注射三次木瓜酵素之後才溶解」,而這種方法最值得一提的是「酵素對腫瘤進行的破壞與分解過程,就在腫瘤的界線旁邊打住」。
二○○一年,德國哈比茲沃瓦爾德診所(Habichtswald-Klinik)的腫瘤科主任醫師沃爾夫魯(Dr. med. Wolfrum)及副主任醫師伯非(Dr. Mihai Palfi)在演講中特別提到:「現已證明經由酵素療法的保護,病人更能適應化療跟放射治療,能迅速緩解放射治療造成的發炎和水腫症狀,提高對放射治療的適應能力,也能減少病人需要服用的藥物。