如同智慧型手機，PDA的好壞也取決於它的作業系統，它必須可以讓你安裝額外的應用程式。Palm生產PDA已有多年歷史，它的作業系統和應用程式對許多使用者來說都已很熟悉，Treo 680和700p已增加手機功能，Palm 700w已開始使用Windows Mobile Pocket PC Edition系統，明年起將要換成Linux作業系統；Palm的電子郵件支援AOL Mail、蘋果（Apple）的Mac、EarthLink、Gmail以及Yahoo Mail，但不支援Hotmail，其自家的VersaMail應用模組也提供包括Exchange ActiveSync的支援，但是你得付錢給GooLink才可以得到電子郵件的支援；網頁瀏覽的效果只能算普通，有點不是那麼跟得上潮流。
Windows Mobile Pocket PC Phone Edition是大家所熟知的Pocket PC作業系統，它雖然具備手機功能，但不如Windows Mobile Smartphones靈巧，但Palm700 W則屬例外，你可以在螢幕上輸入連絡人名字，取得電話然後播號。行動版的Word及Excel可以讓你編輯標準格式的Office文件，但是PowerPoint文件只能閱讀，不能編輯；關於Outlook的整合則非常成功，可以加入連絡人的照片，而且可以接收push email。Pocket的Internet Explorer與一般電腦網頁不同，它會自動調整成適合螢幕的大小。
使用Symbian的PDA手機如Sony Ericsson P990、Nokia 9300 Communicator以及Nokia E62（在英國稱作E61），雖然使用一樣的作業系統，但使用者介面卻大不相同，這些手機都附有軟體可供閱讀、編輯Office檔案以及PIM工具，但push email的服務很不一樣，它們基本上都有內建POP和IMAP用戶端，Symbian則可以與GoodLink、Intellisync、Visto、DataViz RoadSync、Consilient以及Blackberry連線。瀏覽器功能則大相逕庭，通常都是使用行動版本Opera，但Nokia E62的瀏覽器最為出色，不僅可以觀看標準網頁，還有影像縮圖方便快速選取之前觀看過的網頁；雖然如此，你還是沒辦法看到整個網頁，只能看手機上顯示的小型網頁，必須另外使用UMPC（Ultra-mobile PC）才能觀看到整個網頁。
不像Blackberry和Nokia E62這些以商用為主的機型，Sony Ericsson W950手機以音樂為導向，它和一般PDA手機一樣也有相機功能，2007年下半年這些配備照相功能的PDA手機都將以130萬像素為主，最新型的HTC Windows Mobile手機像是Artemis、Tytanu以及幾款智慧型手機則具備了200萬畫素；我們很難發現有更高畫素的智慧型手機以及PDA手機，但畢竟它的設計取向是以商用為主，而非著重在攝影。
Nokia E62所使用的Nokia PC Suite軟體無法在Macs上運作，而且它在Windows系統上的運作，也不如它在Palm Desktop或是Windows Mobile的ActiveSync上運作那般順暢。Blackberry在沒有連結Blackberry Enterprise Server的狀態，所使用的是Intellisync移動式套件，比Nokia PC Suite以及Windows Mobile在速度上較慢。Plam和Windows Mobile的機種在執行同步時，有較多的應用程式可以選擇，甚至也有可支援Mac的應用程式。
PDA手機的內建記憶體大小多半介於20 MB∼100 MB之間，主要工作在於執行作業系統、儲存檔案以及安裝新的應用軟體。如果你打算大量地拍照、播放音樂或是使用GPS，你則需要多個記憶卡，可以試試看使用非揮發性記憶體（non-volatile memory）。Treos和Windows Mobile Pocket PC手機都使用這種記憶體備份以下資料：連絡人、檔案、設定以及新安裝的應用軟體，所以你不用擔心電池耗盡時你會遺失所有的資料，也不必更換SIM卡或記憶卡。
當你買一支PDA手機，你必須還得購買一個合適的手機方案。比起一支智慧型手機，你可能會用PDA手機處理較多的資料，因為它的螢幕較大，瀏覽網頁比較輕鬆，而且又有齊全的鍵盤，可以回覆email。就因為如此，你打電話的頻率也可能變得更高，因為你的手機提供了較多的資訊可以成為通話素材。別指望用即時通訊IM儲存簡訊，英國的電信業者network 3發現大多數的使用者會用即時通訊IM寄出更多的訊息給很久不連絡的朋友。即時路況資訊像是Windows Live Maps、Google Local這些即時線上工具會佔掉不少每月傳輸資料量的空間，所以趕緊去找個傳輸資料量無上限或是傳輸通信費不太貴的方案吧！有些方案甚至還提供Wi-Fi上網，在咖啡館、機場、車站等無線上網的熱點（HotSpot）撥打行動電話上網，可享有免費或是優惠的費率，甚至在一些具有熱點的地方你還可以撥打VOIP（Voice over IP）網路電話。