寶寶有典型半乳糖血症：為體染色體隱性遺傳的醣類代謝異常疾病。由於人體攝入半乳糖後，轉變為葡萄糖的途徑出現障礙，因此會造成體內半乳糖及其代謝物濃度不正常升高。
寶寶有苯酮尿症等代謝疾病：為體染色體隱性遺傳的胺基酸代謝異常疾病，同樣是代謝路徑上有缺陷。病童在適當血液監測下，有時可輪流哺育母乳與特殊奶粉。
母親病毒感染：包括第 I 型或第 II 型人類嗜 T 淋巴球病毒感染、人類免疫不全病毒（愛滋病毒）感染、未經治療的布氏桿菌病、大流行流感感染、動物流感感染等。
母親正在使用藥物：包括偏頭痛藥物（ergotamines）、statins 類降血脂藥物、化學治療藥物等。
母親正使用非法藥物：包括安非他命（amphetamines）。