西元10世紀的著名醫學家嘎西姆•紮哈拉維(Abul Qasim al Zahrawi)出生在穆斯林治理下的西班牙,他被譽為“外科學之父”。紮哈拉維的《醫學手冊》是一部集其數十年醫學知識與經驗的著作,包括30篇的內容,涵蓋大量臨床問題,適用于執業醫生與醫學生。這部著作附有歷史上最早的外科器械插圖與文字說明,而且數量相當豐富,這些精緻的插圖與文字說明使其極具學術價值。他還把外科治療劃分成幾個部分,例如燒灼術、手術切除、放血療法與接骨術。12世紀,《醫學手冊》的外科部分被翻譯成拉丁語,並且在1497-1544年之間至少再版10次之多。從12至15-16世紀,幾乎歐洲所有的醫學家編撰的外科教科書無不參考或引用紮哈拉維原書的譯本。
由於當時中世紀歐洲落後的醫學,人們對於這場瘟疫的來源,也是一個循序漸進的認識過程。與傳說中的歐洲“黑暗的中世紀”形成鮮明對比,同時期的伊斯蘭世界卻處於黃金時代,醫學可謂人才輩出。黑死病氾濫同時期,生活在安達盧西亞穆斯林醫學家伊本•哈提馬(Ibn Khatima)與伊本•海提布(Ibn al Khatib)明確指出,黑死病傳染途徑是“被污染的實體”。幾個世紀之後,微生物學奠基人巴斯德才最終推翻了之前對於黑死病傳染途徑的所有錯誤假設,承認上述兩位穆斯林醫學家的偉大與正確性,最終有了我們今天的微生物學,而這兩位安達盧西亞科學家也被認為提出了微生物學理論的雛形。