金包里慈護宮創廟迄今已有200多年歷史，在前清時期，先民渡海來台墾荒，恭請金面媽祖隨行，保佑安然渡過黑水溝，至金山地區奉祀，因神威顯赫，地方仕紳集資建廟，成為金山、萬里、石門之信仰中心。清嘉慶（西元一七九六年～一八二○年）年間，相傳這尊媽祖神像是於清嘉慶年間漂流海上，並擱淺在野柳海岸石洞，被當地莊民發現，於是就近立草壇奉祀，爾後因這座媽祖神跡屢現、神靈顯赫，信徒大增，吸引了大批民眾前往參拜。嗣後漁民欲於海邊建廟，經聖母指示建廟於金包里街，適先賢黃士進捐獻廟地及水田山林作廟產，鄉仕群起籌募緣金創建廟基，嘉慶十四年（西元1809年）歲次己落成，命名為「天后宮」，奉請本宮開基金面大媽與野柳迎回媽祖同時入火安座，並稱為金面二媽。爾後因從野柳迎回奉祀的媽祖神尊香火鼎盛，遂更名為如今的「慈護宮」，以引顯媽祖『慈恩浩翰，護佑眾生』。
